Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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