Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms