Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms