Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms