Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ctu1Q99J10 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ctu1Q99J10 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ctu1Q99J10 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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