Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms