Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps3Q91VB4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms