Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms