Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nsl1Q8K305 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nsl1Q8K305 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nsl1Q8K305 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nsl1Q8K305 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nsl1Q8K305 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms