Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Neurl3Q8CJC5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Neurl3Q8CJC5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Neurl3Q8CJC5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Neurl3Q8CJC5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Neurl3Q8CJC5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Neurl3Q8CJC5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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