Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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