Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LgsnQ8CIX8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LgsnQ8CIX8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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LgsnQ8CIX8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms