Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms