Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms