Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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