Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nhlrc3Q8CCH2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nhlrc3Q8CCH2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nhlrc3Q8CCH2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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