Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4aQ8C9S8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg4aQ8C9S8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Atg4aQ8C9S8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg4aQ8C9S8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Atg4aQ8C9S8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Atg4aQ8C9S8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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