Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms