Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8C5C9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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