Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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