Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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