Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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