Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Lrfn4Q80XU8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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