Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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