Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubfd1Q78JW9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubfd1Q78JW9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubfd1Q78JW9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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