Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynmQ70IV5 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms