Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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