Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Timd4Q6U7R4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Timd4Q6U7R4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Timd4Q6U7R4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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