Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms