Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms