Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms