Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

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Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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