Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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