Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtmQ62388 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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AtmQ62388 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtmQ62388 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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