Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms