Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5dQ62240 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms