Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms