Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms