Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccne1Q61457 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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