Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pde3bQ61409 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pde3bQ61409 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pde3bQ61409 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pde3bQ61409 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms