Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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BcanQ61361 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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