Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms