Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms