Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp7Q60973 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms