Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms