Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms