Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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