Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms