Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf608Q56A10 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms