Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trp53i11Q4QQM4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms